デジタルドロップレットPCR画像の蛍光情報抽出

LI Shanshan ,  

WANG Zichao ,  

YU Chengzhuang ,  

WEI Chunyang ,  

LI Junwei ,  

摘要

デジタルドロップレットポリメラーゼ連鎖反応(ddPCR)での核酸検出において、液滴の数が多く、サイズが小さく、密に配置され、蛍光強度が不均一なため液滴のカウントが困難になる問題に対して、画像処理法を提案した。輝度走査法に基づき画像情報を取得し、微分解析法により液滴を分類およびカウントすることで、ddPCR実験の画像情報を正確に取得できる。畳み込みアルゴリズムで画像のノイズを除去し、輝度分布均等化法で画像のコントラストを強化する。輝度走査方式で各閾値ごとに画像を二値化し、幾何学的条件を制限して液滴数を集計する。微分解析法でデータを解析し、蛍光液滴と全液滴のカウント結果を導き出す。ヒトのゲノムDNA(gDNA)を検出サンプルとしたddPCR実験において、このアルゴリズムの平均検出精度は99.36%で、商用機器アルゴリズムおよび同種のアルゴリズムと比較してそれぞれ2.24%、2.53%向上した。この方法はddPCR実験に信頼できる検出結果を提供し、ddPCR実験により適している。

关键词

蛍光スポット検出; デジタルドロップレットPCR; 核酸検出; 画像処理; 画像解析

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